1978年6月，省革委会批复同意我校的机构调整，又再一次恢复了基础医学部的名称，葛志恒任基础医学部主任，朱林森任党总支书记。经过十一届三中全会后的拨乱反正和稳步调整，基础医学部逐步恢复元气，走上了发展道路。同时随着学科规模的发展壮大，基础医学部将各教研组改组为教研室，到1980年基础医学部已有16个教研室和1个部办公室，拥有教职员工372人，其中教授6名，副教授40名，讲师108名，助理研究员2名，规模得到了迅猛扩展。
      基础医学部抓住了改革开放的机遇，调动一切积极力量，努力实现各项事业的复兴。在教学上，主编和参编了8种全国医学院校统编教材；在科研上，仅1978年到1982年就有省级以上科研成果19项。同时，基础医学部承担了重点课题的研究，其中对血吸虫病免疫诊断的研究、对中华按蚊唾腺染色体型的研究、对动脉粥样硬化的研究等都取得了较为突出的成绩；在学科建设上，寄生虫学、药理学先后成为博士授权点，人体解剖学等9个学科成为第一批硕士学位授权点，1993年，寄生虫学、药理学、病理生理学、生理学被评为省级重点学科，医学分子生物学实验室被确定为首批省级重点实验室；在人才培养方面，继续承担全校各专业各层次学生的公共课和基础课的教学工作，同时有9个学科为全国医学教育进修基地。基础医学部处于大发展时期。