2011年1月10日下午，基础医学院第二届教职工代表大会第三次全体会议在先知楼302报告厅召开，出席本次大会的共有教代会正式代表71人、大会由基础医学院党委书记陈春燕主持。
　　 本次会议的主要内容为：一、听取院长的2010年度工作报告；二、听取执委会提案工作情况报告：三、讨论、审议院长年度工作报告和提案工作情况报告；通过学院五项制度和学院教代会工作条例修改内容。
　　 朱昌亮院长首先做2010年学院行政工作报告。他说2010年是全院完成“十一五”发展规划的关键一年，也是为“十二五”谋划的奠基之年。一年来，学院以科学发展观统领全局，深化内涵建设，锐意创新、 奋发进取，圆满完成各项工作任务，顺利实现“十一五”发展规划的目标，学院整体水平得到提升，为下一阶段“十二五”建设奠定了坚实的基础。报告从教育教学、科学研究与交流合作、学科建设和行政管理四个方面回顾和总结了2010年学院取得的成绩，同时也指出了学院发展中存在的问题和困难。
　　 在对2011年工作的展望中，朱院长指出，2011年是“十二五”发展规划的开局之年，学院将以学校“十二五”发展规划为指南，紧密结合院“十二五”发展规划制定的各项工作任务，认真分析目前学院发展面临的新形势、新特点，抓住机遇，精心谋划，推进学院各项工作持续发展，为“十二五”时期的发展开好局、起好步。
　　 王迎伟副院长代表第二届教职工代表大会执委会做提案工作报告，对第二次会议接受的代表提案的承办实施和反馈情况向大会做了汇报。
　　 随后，各代表团还对院长的年度工作报告、提案工作情况报告及有关制度修改的内容进行了分组讨论。
　　 最后，大会通过了院长的年度工作报告、提案工作情况报告以及《南京医科大学基础医学院教职工代表大会条例》关于代表增加的内容等有关制度修改的内容。